水文地質組已於2022年2月另成立[深地質研究專案計畫]。

台灣近年來隨著社會經濟的蓬勃發展，城鄉建設的迅速開發，已衍生出許多地下水污染、水資源供需不平衡、或是工程災害等問題，而在全球氣候變遷的影響下，更促使山區不論在地質與環境上均發生了嚴重的災害。由於此相關問題多發生在複雜多變的地層中，伴隨而來的往往是高度的不確定性，以致在面對問題時多無法得到最佳的解決方案；而水文地質調查係藉由測繪、探勘、製圖、試驗、監測及模擬分析等方法來掌握地下水流動行為、地形地質構造特性及變化、以及兩者間之關聯性，透過調查結果可大幅釐清諸多的不確定性，對於問題的探究或災害的預防提供了相當重要的依據。

水文地質調查組於98年11月設立於中興社大地工程研究中心下，旨在協助解決國內面臨之水文地質相關問題，並積極投入開發水文地質技術，包括調查、試驗、設備、參數評估、水文地質模式建置、分析方法及對策等，以維持國內技術領先及與同業競爭之優勢。